แอสตาแซนธินเป็นเม็ดสีแดงที่มีอยู่ในสิ่งมีชีวิตทางธรรมชาติหลายชนิดแอสตาแซนธินธรรมชาติส่วนใหญ่พบในสิ่งมีชีวิตในทะเลซึ่งแตกต่างจากคลอโรฟิลล์และβแคโรทีนในพืชบก มันเป็นรูปแบบของสาหร่ายขนาดเล็กที่บริโภคโดยสิ่งมีชีวิตในน้ําหลายชนิด ผิวคล้ําสีแดงเข้มของ Astaxanthin ทําให้เหล่านี้มีเนื้อหรือเปลือกหอยสีแดงหรือสีชมพู
ปลาแซลมอนสีแดงที่พบในมหาสมุทรแปซิฟิกป่าเป็นหนึ่งในความเข้มข้นสูงสุดของแอสตาแซนธินธรรมชาติยกเว้น H. Pluvialis เม็ดสีนี้ช่วยให้เนื้อปลามีคุณสมบัติต้านอนุมูลอิสระสีแดงเข้มและมีสุขภาพดีอย่างไม่น่าเชื่อ แหล่งธรรมชาติอื่น ๆ ของแอสตาแซนธิน ได้แก่ กุ้งก้ามกรามกุ้งอาร์กติกปูกั้งปลาเทราท์แดงสาหร่ายและคริลล์ นกสีแดงมักจะได้รับสีของพวกเขาโดยการกินปลาและพืชที่อุดมไปด้วยแอสตาแซนธินแต่ความเข้มข้นของเม็ดสีมักจะต่ํา
แม้ว่าทะเลจะเป็นแหล่งที่พบบ่อยที่สุดของแอสตาแซนธินธรรมชาติไม่ จํากัด เฉพาะพืชและที่ใช้น้ํา ตัวอย่างเช่นยีสต์ที่เรียกว่า Xanthophyllomyces dendrorhous (ยีสต์ Phaffia) ยังมีแอสตาแซนธินในระดับที่ค่อนข้างสูง เป็นผู้ผลิตแอสตาแซนธิน มันจะไม่ดูดซับจากแหล่งอินทรีย์อื่น ๆ
